More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1954 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.35 
 
 
406 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.8 
 
 
406 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  95.79 
 
 
404 aa  816    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.09 
 
 
406 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
404 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.54 
 
 
404 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  80 
 
 
406 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.65 
 
 
406 aa  760    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  65.37 
 
 
406 aa  542  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  66.41 
 
 
398 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  65.99 
 
 
397 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  63.21 
 
 
401 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  65.99 
 
 
397 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  62.72 
 
 
397 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  63.04 
 
 
397 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  64.54 
 
 
402 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  63.04 
 
 
397 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  63.04 
 
 
397 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  63.38 
 
 
386 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  63.54 
 
 
397 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  63.96 
 
 
398 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  64.47 
 
 
398 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.88 
 
 
398 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.82 
 
 
401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  58.46 
 
 
456 aa  496  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  60.52 
 
 
391 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  61.82 
 
 
361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  61.82 
 
 
361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  61.54 
 
 
361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  48.43 
 
 
399 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  44.56 
 
 
384 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.86 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 
384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 
384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.5 
 
 
384 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  43.3 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  43.99 
 
 
384 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
383 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  42.22 
 
 
418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
384 aa  306  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  41.27 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  40.11 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  40.37 
 
 
418 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.96 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  37.11 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  38.31 
 
 
384 aa  237  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 
389 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  32.81 
 
 
388 aa  216  5e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
382 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
390 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  36.68 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.4 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.04 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  25.76 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  26.27 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  25.58 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.2 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  24.93 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  26.38 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  26.44 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  24.22 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  28.35 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.08 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  28.33 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  27.12 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
672 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28436  predicted protein  22.22 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.981299  normal  0.211421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33729  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.95 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000109637  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28493  predicted protein  21.95 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000203706  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  26.38 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.95 
 
 
311 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  24.71 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  30.87 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  32.91 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>