More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0393 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  100 
 
 
388 aa  800    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  66.41 
 
 
384 aa  546  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.81 
 
 
389 aa  457  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  45.62 
 
 
399 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 
382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 
383 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.56 
 
 
384 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.56 
 
 
384 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  44.04 
 
 
384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.52 
 
 
384 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.82 
 
 
384 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
383 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  44.39 
 
 
384 aa  338  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  42.39 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  41.62 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  42.34 
 
 
382 aa  336  5e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  42.27 
 
 
417 aa  333  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  42.01 
 
 
418 aa  332  6e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.42 
 
 
382 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  39.8 
 
 
395 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.33 
 
 
392 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  37.88 
 
 
456 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
390 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 
382 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  36.1 
 
 
392 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  37.37 
 
 
401 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  37.94 
 
 
406 aa  245  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.95 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
401 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  35.68 
 
 
402 aa  235  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  34.86 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  37.99 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  39.39 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.48 
 
 
397 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.48 
 
 
397 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  37.03 
 
 
391 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.22 
 
 
397 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.96 
 
 
397 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.22 
 
 
397 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  36.31 
 
 
386 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.87 
 
 
397 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  36.13 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
404 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  34.36 
 
 
404 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
406 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
398 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  32.49 
 
 
361 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  32.49 
 
 
361 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  32.49 
 
 
361 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.91 
 
 
320 aa  62.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  30.71 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  21.33 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.81 
 
 
331 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 
348 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  29.88 
 
 
308 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
341 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
335 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
335 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.55 
 
 
306 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  17.82 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.89 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 
285 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.81 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.89 
 
 
349 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  20 
 
 
339 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  26.13 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  24.73 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.04 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.74 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 
311 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.49 
 
 
332 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.01 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.01 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.01 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.01 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
327 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.01 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.01 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.02 
 
 
336 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.01 
 
 
348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
326 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  24.41 
 
 
330 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.46 
 
 
332 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>