More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1227 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
404 aa  840    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  99.75 
 
 
404 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  80.25 
 
 
406 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.56 
 
 
406 aa  685    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.59 
 
 
406 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.54 
 
 
404 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.15 
 
 
406 aa  763    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.09 
 
 
406 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  64.86 
 
 
406 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  66.16 
 
 
398 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  65.74 
 
 
397 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  65.74 
 
 
397 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  64.29 
 
 
402 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  62.69 
 
 
401 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  63.64 
 
 
386 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  62.47 
 
 
397 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.13 
 
 
398 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  64.21 
 
 
398 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  64.47 
 
 
398 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  62.78 
 
 
397 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  62.78 
 
 
397 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.07 
 
 
401 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  63.29 
 
 
397 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  62.78 
 
 
397 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  57.96 
 
 
456 aa  489  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  61.3 
 
 
391 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  61.82 
 
 
361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  61.82 
 
 
361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  61.82 
 
 
361 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  47.91 
 
 
399 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  45.08 
 
 
384 aa  332  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.72 
 
 
399 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.13 
 
 
404 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 
382 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  43.81 
 
 
382 aa  316  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
384 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
384 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.5 
 
 
384 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.65 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 
383 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  43.99 
 
 
384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  41.01 
 
 
390 aa  306  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  41.94 
 
 
418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  40.11 
 
 
417 aa  277  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  40.37 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  36.86 
 
 
395 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.17 
 
 
382 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  38.03 
 
 
384 aa  232  7.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
389 aa  219  5e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  34.36 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
392 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
390 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
382 aa  206  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  34.79 
 
 
392 aa  199  9e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.84 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.58 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  25.48 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  25.58 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  27.37 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  26.15 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  25.78 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  24.22 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.45 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  25.51 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  26.12 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  25.14 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.26 
 
 
336 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  24.08 
 
 
338 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
367 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  27.3 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
358 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
672 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
310 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
314 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34177  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
346 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
321 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  29.78 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.8 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  23.66 
 
 
329 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
318 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  25.21 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>