More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5143 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
398 aa  820    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  84.76 
 
 
361 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  84.21 
 
 
361 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  84.21 
 
 
361 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.14 
 
 
406 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.66 
 
 
406 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  63.38 
 
 
404 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.13 
 
 
404 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.18 
 
 
406 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.88 
 
 
404 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.37 
 
 
406 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  61.21 
 
 
406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  60.56 
 
 
401 aa  514  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  62.6 
 
 
386 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  62.37 
 
 
406 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  59.34 
 
 
397 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  59.34 
 
 
397 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  63.24 
 
 
391 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  59.3 
 
 
398 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  57.95 
 
 
397 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  57.95 
 
 
397 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  57.69 
 
 
397 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  57.58 
 
 
397 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  60.62 
 
 
398 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  60.88 
 
 
402 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  58.29 
 
 
398 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.37 
 
 
401 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  57.36 
 
 
456 aa  479  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  56.71 
 
 
397 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  51 
 
 
399 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  48.59 
 
 
384 aa  348  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.41 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 
384 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  45.38 
 
 
382 aa  330  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
384 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
384 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.41 
 
 
399 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.04 
 
 
383 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.41 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  44.5 
 
 
418 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  44.7 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  44.36 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.39 
 
 
383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.1 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  41.33 
 
 
417 aa  291  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  41.07 
 
 
418 aa  288  8e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 
382 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  37.56 
 
 
395 aa  252  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  39.28 
 
 
384 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 
389 aa  226  8e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  32.55 
 
 
388 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 
392 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.12 
 
 
390 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  36.97 
 
 
392 aa  193  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
382 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.62 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.96 
 
 
298 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
333 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
313 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
312 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  24.65 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
310 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.16 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
317 aa  59.7  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  25.14 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25.94 
 
 
336 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.95 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  27.8 
 
 
334 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  25.5 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2064  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  24 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3082  UDP-glucose 4-epimerase  28.41 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
327 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  25.14 
 
 
319 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28436  predicted protein  24.16 
 
 
360 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.981299  normal  0.211421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  23.21 
 
 
302 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.98 
 
 
318 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28493  predicted protein  23.85 
 
 
360 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000203706  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
336 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33729  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
360 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000109637  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  26.49 
 
 
338 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
335 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  25.76 
 
 
338 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
306 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
335 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>