More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3188 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 334 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  92.51 
 
 		 334 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  65.76 
 
 		 336 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.57 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  64.13 
 
 		 335 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  64.63 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.86 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  63.64 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.86 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  61.45 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  64.16 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  60.18 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.27 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.96 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  57.36 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.91 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  59.21 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.01 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.31 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  53.57 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.79 
 
 		 340 aa  349  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.39 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.52 
 
 		 337 aa  345  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  53.64 
 
 		 334 aa  335  9e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.55 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 		 331 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  50.89 
 
 		 341 aa  328  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  47.79 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.77 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.06 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  49.7 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.45 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.58 
 
 		 332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  46.5 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 		 341 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  46.97 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.8 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 		 344 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  48.5 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.2 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  41.69 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  44.84 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.18 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.79 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.88 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.13 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  43.66 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.29 
 
 		 340 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 346 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  47.35 
 
 		 341 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.95 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  43.07 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  45.16 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.74 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 338 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.76 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.99 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.49 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.99 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  46.78 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.99 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  42.69 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  42.69 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.69 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  45.7 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.69 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.2 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.54 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.69 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.07 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.39 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  43.88 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  44.48 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  44.87 
 
 		 342 aa  272  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>