More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1387 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  74.71 
 
 
344 aa  537  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  71.51 
 
 
346 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  73.13 
 
 
343 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.47 
 
 
345 aa  521  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.98 
 
 
345 aa  524  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  71.47 
 
 
345 aa  521  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  71.76 
 
 
345 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  74.26 
 
 
342 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  71.18 
 
 
345 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  72.54 
 
 
344 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  71.18 
 
 
345 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  71.47 
 
 
345 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  71.47 
 
 
345 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  70.8 
 
 
345 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  70.88 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.62 
 
 
345 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  70.29 
 
 
345 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  73.53 
 
 
348 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  69.71 
 
 
345 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  69.71 
 
 
345 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  69.71 
 
 
345 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  69.62 
 
 
345 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  69.41 
 
 
345 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  69.41 
 
 
345 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  68.64 
 
 
347 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  68.45 
 
 
344 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.13 
 
 
344 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  65.49 
 
 
347 aa  455  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.16 
 
 
344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.94 
 
 
349 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  60.47 
 
 
354 aa  435  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.71 
 
 
342 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  59.71 
 
 
342 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  64.01 
 
 
345 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  63.72 
 
 
345 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  64.01 
 
 
345 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  64.01 
 
 
345 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.24 
 
 
337 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  64.01 
 
 
345 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  64.01 
 
 
345 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  64.01 
 
 
345 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.49 
 
 
342 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  59.29 
 
 
339 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4220  alcohol dehydrogenase  62.46 
 
 
347 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.53 
 
 
341 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.6 
 
 
342 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1605  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.48 
 
 
352 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954411  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5953  alcohol dehydrogenase  58.96 
 
 
352 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95038  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3963  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.25 
 
 
352 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4404  alcohol dehydrogenase  59.25 
 
 
352 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4293  alcohol dehydrogenase  57.85 
 
 
352 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.04 
 
 
338 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3825  alcohol dehydrogenase  58.14 
 
 
352 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  57.74 
 
 
338 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.44 
 
 
338 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  57.01 
 
 
339 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.46 
 
 
341 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  55.56 
 
 
341 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.86 
 
 
341 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  56.16 
 
 
340 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  55.59 
 
 
341 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.58 
 
 
340 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.68 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  53.08 
 
 
342 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  51.03 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.24 
 
 
341 aa  352  7e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  52.35 
 
 
340 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.09 
 
 
344 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179819 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.71 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4427  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.11 
 
 
335 aa  319  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  49.55 
 
 
332 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.26 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.21 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.75 
 
 
334 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.09 
 
 
336 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.39 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  45.86 
 
 
332 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  47.97 
 
 
336 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
338 aa  301  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 
339 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
333 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  45.48 
 
 
334 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  43.92 
 
 
332 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.43 
 
 
344 aa  298  9e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  45.19 
 
 
334 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.21 
 
 
332 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.27 
 
 
340 aa  295  6e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
332 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.74 
 
 
333 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
333 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.35 
 
 
335 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 
332 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
338 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>