More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3139 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 332 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  56.57 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.93 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.76 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.8 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 		 333 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 		 333 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.76 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.32 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.19 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.85 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  46.55 
 
 		 337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.81 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  48.63 
 
 		 339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 		 334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  47.15 
 
 		 332 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  47.29 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  48.02 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.38 
 
 		 337 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  47.42 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.37 
 
 		 344 aa  298  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 337 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  46.87 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 		 342 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.78 
 
 		 334 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  44.31 
 
 		 345 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  45.37 
 
 		 333 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  43.84 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  45.51 
 
 		 345 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  45.81 
 
 		 386 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.01 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.88 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.5 
 
 		 333 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.01 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 		 341 aa  291  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  46.5 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  48.35 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.11 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  47.31 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.71 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.81 
 
 		 345 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.55 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.15 
 
 		 341 aa  286  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.02 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.75 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.01 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  47.31 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 347 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  44.48 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.53 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.71 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.59 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.27 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.555939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.15 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.29 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.45 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.15 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  42.22 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  46.11 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.55 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  43.45 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.03 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  43.45 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.15 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.62 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4427  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.11 
 
 		 335 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  44.98 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.35 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1097  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  44.05 
 
 		 339 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>