More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1158 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
338 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.06 
 
 
336 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.86 
 
 
346 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.55 
 
 
339 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  56.93 
 
 
336 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  56.12 
 
 
334 aa  364  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  56.33 
 
 
334 aa  361  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  52.98 
 
 
335 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.12 
 
 
336 aa  349  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  52.84 
 
 
336 aa  349  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  53.25 
 
 
337 aa  345  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.8 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  52.58 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 
341 aa  342  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.65 
 
 
343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  52.41 
 
 
339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.85 
 
 
349 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.85 
 
 
334 aa  335  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.06 
 
 
340 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.41 
 
 
334 aa  329  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.34 
 
 
337 aa  328  8e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
334 aa  328  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  50 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  50.29 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  48.49 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.19 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 
337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 
337 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
331 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
331 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.2 
 
 
340 aa  290  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
332 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.07 
 
 
334 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  45.02 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 
337 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
331 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  43.73 
 
 
331 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.84 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.37 
 
 
332 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.15 
 
 
337 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.97 
 
 
344 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.07 
 
 
332 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.88 
 
 
333 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 
339 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
332 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  43.88 
 
 
333 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  44.11 
 
 
334 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  43.88 
 
 
333 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.66 
 
 
336 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
344 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  43.41 
 
 
334 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.36 
 
 
336 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  43.95 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
340 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 
333 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 
335 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  41.59 
 
 
345 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 
332 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  41.59 
 
 
345 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  41.3 
 
 
345 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  41.3 
 
 
345 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  41.3 
 
 
345 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.11 
 
 
341 aa  255  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
339 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.49 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.69 
 
 
345 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  41.19 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.07 
 
 
344 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 
339 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.07 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.71 
 
 
345 aa  252  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 
347 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.41 
 
 
345 aa  252  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
338 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.36 
 
 
338 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.98 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  43.36 
 
 
338 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
334 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.67 
 
 
340 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.41 
 
 
345 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 
345 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.41 
 
 
345 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 
338 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 
338 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 
338 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  40.12 
 
 
345 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 
345 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  40.12 
 
 
345 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.12 
 
 
345 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.39 
 
 
338 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
340 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  41 
 
 
346 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.99 
 
 
334 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.94 
 
 
341 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  42.86 
 
 
341 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>