More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0381 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  693    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.38 
 
 
338 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.64 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  56.64 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  56.64 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  57.52 
 
 
338 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  57.52 
 
 
338 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  55.92 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  55.92 
 
 
469 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  55.92 
 
 
406 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  55.92 
 
 
479 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  55.62 
 
 
422 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  55.92 
 
 
338 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  55.92 
 
 
427 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.62 
 
 
338 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.32 
 
 
341 aa  345  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  50.59 
 
 
334 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  49.7 
 
 
334 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 
333 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.5 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3516  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.39 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.21 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  49.27 
 
 
344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  48.83 
 
 
339 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 
333 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.96 
 
 
334 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  47.54 
 
 
342 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.09 
 
 
344 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.25 
 
 
342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 
346 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.37 
 
 
344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  47.23 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  46.15 
 
 
386 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.64 
 
 
335 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  46.06 
 
 
345 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
344 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  46.29 
 
 
339 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  46.94 
 
 
353 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
339 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.75 
 
 
345 aa  295  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  45.88 
 
 
345 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.88 
 
 
345 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
347 aa  295  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.88 
 
 
345 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
339 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.88 
 
 
345 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
339 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  47.79 
 
 
337 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.57 
 
 
358 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 
340 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 
343 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.47 
 
 
345 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.54 
 
 
344 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45.59 
 
 
345 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  45.59 
 
 
345 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
335 aa  292  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.29 
 
 
345 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.76 
 
 
337 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
332 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.4 
 
 
345 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  45.4 
 
 
345 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.18 
 
 
345 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.29 
 
 
345 aa  288  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
341 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  44.22 
 
 
343 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
332 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.71 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  48.84 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
340 aa  285  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.61 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.01 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.15 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.28 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  47.6 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.67 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.28 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  48.22 
 
 
338 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 
332 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.93 
 
 
338 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  47.48 
 
 
338 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  47.65 
 
 
336 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.18 
 
 
334 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
334 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
333 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
333 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.06 
 
 
336 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.06 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  45.66 
 
 
348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.76 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  45.32 
 
 
340 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>