More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1037 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  85.84 
 
 
332 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.64 
 
 
332 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  76.81 
 
 
332 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  76.81 
 
 
332 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  77.11 
 
 
332 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  76.81 
 
 
332 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  76.81 
 
 
332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  76.51 
 
 
332 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  76.81 
 
 
332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  76.81 
 
 
332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  76.81 
 
 
332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  76.2 
 
 
332 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.51 
 
 
337 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.45 
 
 
336 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.86 
 
 
336 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.87 
 
 
337 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  67.86 
 
 
336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  68.06 
 
 
338 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  66.86 
 
 
340 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.86 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.76 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  66.57 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  66.27 
 
 
338 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.67 
 
 
338 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  65.67 
 
 
339 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.58 
 
 
338 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  64.29 
 
 
339 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  53.12 
 
 
337 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.63 
 
 
337 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.64 
 
 
344 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.37 
 
 
345 aa  322  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  47.63 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.07 
 
 
345 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  48.36 
 
 
339 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.25 
 
 
341 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  47.48 
 
 
346 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
337 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  48.37 
 
 
345 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.48 
 
 
345 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  47.48 
 
 
345 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  47.48 
 
 
345 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.48 
 
 
345 aa  308  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  47.48 
 
 
345 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.39 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 
342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  48.2 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.48 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.46 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  46.88 
 
 
345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.02 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.02 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.73 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.88 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.75 
 
 
334 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
339 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.96 
 
 
338 aa  299  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
332 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  48.05 
 
 
334 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.55 
 
 
338 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
335 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.43 
 
 
341 aa  295  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  46.85 
 
 
334 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  48.21 
 
 
348 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  46.9 
 
 
342 aa  295  9e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
338 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
332 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 
332 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.03 
 
 
344 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.32 
 
 
342 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.72 
 
 
334 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
347 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.25 
 
 
341 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.94 
 
 
342 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
333 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
344 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.45 
 
 
342 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  48.97 
 
 
341 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.82 
 
 
344 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  49.7 
 
 
347 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.11 
 
 
340 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.6 
 
 
341 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
331 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
333 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  46.59 
 
 
340 aa  286  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>