More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0539 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 334 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  67.77 
 
 		 334 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  66.57 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  62.54 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.17 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.58 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  60.78 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  61.45 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  61.68 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.24 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  57.53 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  55.42 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.48 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.66 
 
 		 336 aa  364  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  58.86 
 
 		 341 aa  358  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.82 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.48 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 336 aa  352  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  51.95 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.81 
 
 		 338 aa  328  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.41 
 
 		 338 aa  318  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.4 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.87 
 
 		 340 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  48.06 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  52.8 
 
 		 339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.76 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.55 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  47.76 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.81 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  47.76 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.5 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  47.59 
 
 		 331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  48.2 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 		 341 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.96 
 
 		 341 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 		 332 aa  298  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  42.99 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.72 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.45 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.78 
 
 		 332 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  48.02 
 
 		 334 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4427  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.55 
 
 		 335 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  47.59 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.97 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.73 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  47.72 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.43 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.9 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  44.21 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  46.55 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.83 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.81 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.11 
 
 		 344 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  46.2 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  46.53 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 		 332 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.55 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.85 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.75 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.24 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  44.24 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  44.24 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  45.7 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.74 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.94 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.55 
 
 		 345 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.55 
 
 		 345 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.32 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.16 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.18 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.5 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  45.86 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  46.85 
 
 		 332 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.57 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  43.81 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  45.88 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.1 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.81 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>