More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1098 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 341 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  56.6 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  55.45 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  55.15 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.15 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  55.12 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  53.61 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  53.45 
 
 		 332 aa  362  4e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 		 331 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 		 331 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  53.01 
 
 		 332 aa  358  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 		 331 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  52.55 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  53.57 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  53.57 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.25 
 
 		 349 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  51.94 
 
 		 333 aa  347  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.87 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.95 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.61 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  50.3 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  50.6 
 
 		 336 aa  322  7e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.51 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.63 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  49.7 
 
 		 339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.35 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.96 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.1 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.87 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.65 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.97 
 
 		 344 aa  298  7e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.96 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  42.81 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.51 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.45 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.25 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.56 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.36 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  46.02 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  41.4 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  41.79 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.91 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 		 335 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.61 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  44.67 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.55 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  39.47 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.97 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  40.9 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.27 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.59 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.36 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.58 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.18 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.14 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.12 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.12 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.12 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.12 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.27 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  40.6 
 
 		 386 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.4 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.12 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.47 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.34 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.05 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.83 
 
 		 345 aa  262  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.12 
 
 		 345 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  41.12 
 
 		 345 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.23 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  44.05 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>