More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1055 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 337 aa  689    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  51.49 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  54.35 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.7 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.08 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  47.52 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.37 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  48.36 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  45.61 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.91 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  47.93 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  47.02 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  47.76 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.32 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  44.74 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.24 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.32 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.24 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 		 338 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.35 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.92 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.35 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.57 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.57 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  43.84 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  43.41 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.11 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  44.74 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.13 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.38 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.48 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.96 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.34 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.36 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.37 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.24 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.08 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.05 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.77 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  43.41 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.75 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.18 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.77 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.6 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.18 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  38.82 
 
 		 342 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  40.53 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.57 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  39.71 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.94 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  40.12 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4220  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.48 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.13 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  42.4 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.24 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.03 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.53 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.879431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>