More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3459 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 339 aa  680    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 		 331 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.16 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.81 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.27 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.92 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.62 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.97 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  46.09 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.01 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 		 339 aa  262  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.57 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.51 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  42.14 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 		 333 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  42.64 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.81 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.21 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  46.45 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 334 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.32 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  44.61 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  41.74 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.57 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.57 
 
 		 336 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  41.45 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  40.61 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.32 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  46.57 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  43.33 
 
 		 332 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.62 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.02 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.02 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 		 332 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.74 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  40.88 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  45.27 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 		 345 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.67 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.07 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  45.02 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.58 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  41.69 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.71 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.45 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.71 
 
 		 339 aa  238  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  43.98 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.49 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.42 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.84 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  43.66 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.42 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  40.88 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.34 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.42 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  39.42 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  39.42 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.42 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.4 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.42 
 
 		 339 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.25 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.13 
 
 		 345 aa  235  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>