More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2145 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
341 aa  690    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.56 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.29 
 
 
335 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  45.24 
 
 
386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  46.73 
 
 
334 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
333 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.51 
 
 
333 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.07 
 
 
338 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
338 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
338 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
338 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
333 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.64 
 
 
334 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
333 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
338 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  44.78 
 
 
334 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.65 
 
 
339 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
338 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
340 aa  282  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.08 
 
 
344 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 
335 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.08 
 
 
344 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.06 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.06 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.6 
 
 
342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.06 
 
 
479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.06 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  45.13 
 
 
345 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  44.87 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
341 aa  271  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
342 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.77 
 
 
406 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.45 
 
 
338 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.77 
 
 
338 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.77 
 
 
422 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.08 
 
 
345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  43.95 
 
 
345 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.88 
 
 
345 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 
339 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.58 
 
 
345 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.57 
 
 
344 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.75 
 
 
345 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.47 
 
 
332 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.75 
 
 
345 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
339 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
339 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.71 
 
 
337 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  42.18 
 
 
342 aa  262  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
347 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.24 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.45 
 
 
345 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
345 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 
339 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
332 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  42.23 
 
 
345 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.23 
 
 
345 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.23 
 
 
345 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.23 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.23 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  43.15 
 
 
345 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  41.28 
 
 
343 aa  258  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 
332 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  43.15 
 
 
345 aa  258  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.25 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.56 
 
 
345 aa  255  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1147  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
364 aa  255  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145714  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.56 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.47 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
332 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.37 
 
 
349 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  43.41 
 
 
332 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.55 
 
 
332 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.69 
 
 
334 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
332 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.55 
 
 
332 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.8 
 
 
341 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.55 
 
 
332 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.55 
 
 
332 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.55 
 
 
332 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
332 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.55 
 
 
332 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
337 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 
344 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
337 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 
331 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
338 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.55 
 
 
332 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 
331 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
339 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.99 
 
 
337 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  38.25 
 
 
331 aa  245  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2983  hypothetical protein  41.46 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.18 
 
 
342 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
332 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>