More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3852 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
339 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 
341 aa  345  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  49.41 
 
 
338 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.41 
 
 
338 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  49.41 
 
 
338 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  48.5 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  49.41 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
338 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.82 
 
 
338 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  47.9 
 
 
334 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.65 
 
 
333 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.88 
 
 
344 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  46.67 
 
 
334 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.59 
 
 
335 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  44.07 
 
 
386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.59 
 
 
334 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.79 
 
 
338 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.34 
 
 
406 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.34 
 
 
469 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.34 
 
 
422 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.34 
 
 
427 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.34 
 
 
338 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.34 
 
 
479 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.34 
 
 
338 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.65 
 
 
341 aa  292  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
344 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1147  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145714  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.84 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 
339 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.46 
 
 
332 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.54 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.25 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.25 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.25 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.28 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  44.28 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.38 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  44.25 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  44.25 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.25 
 
 
345 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
347 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 
347 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
343 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 
346 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.95 
 
 
345 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
341 aa  278  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.36 
 
 
345 aa  275  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  43.36 
 
 
339 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.07 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.05 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.07 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  42.77 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.77 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  42.77 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.77 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 
341 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.67 
 
 
340 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.15 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.96 
 
 
342 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
342 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
337 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 
347 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.01 
 
 
344 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.4 
 
 
347 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 
337 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.14 
 
 
332 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
342 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
340 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  41.76 
 
 
345 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  45.1 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  41.4 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 
341 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  43.92 
 
 
332 aa  268  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.27 
 
 
332 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.97 
 
 
358 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.27 
 
 
332 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
332 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.27 
 
 
332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.35 
 
 
341 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.27 
 
 
332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.27 
 
 
332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.29 
 
 
344 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.27 
 
 
332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.18 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 
332 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.27 
 
 
332 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
337 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 
341 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
332 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  43.44 
 
 
339 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.39 
 
 
340 aa  263  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.39 
 
 
337 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
332 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 
342 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>