More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2754 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.88 
 
 
349 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  64.07 
 
 
332 aa  425  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  61.45 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  62.46 
 
 
336 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  60.84 
 
 
334 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  58.36 
 
 
335 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.45 
 
 
334 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  59.39 
 
 
337 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.23 
 
 
334 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.35 
 
 
343 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  55.29 
 
 
339 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  58.86 
 
 
341 aa  364  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.06 
 
 
339 aa  362  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.98 
 
 
338 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.71 
 
 
337 aa  355  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  56.02 
 
 
336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.55 
 
 
346 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  51.94 
 
 
341 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  52.79 
 
 
341 aa  341  9e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.29 
 
 
336 aa  339  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.65 
 
 
336 aa  335  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.45 
 
 
340 aa  334  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
332 aa  332  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
332 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
337 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.25 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
331 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  49.25 
 
 
337 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  49.25 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
332 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 
334 aa  321  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
331 aa  318  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  48.2 
 
 
331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
337 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  49.24 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.7 
 
 
344 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.4 
 
 
340 aa  295  7e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.37 
 
 
332 aa  295  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.62 
 
 
337 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.32 
 
 
334 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  48.2 
 
 
336 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.97 
 
 
336 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.67 
 
 
336 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.22 
 
 
334 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.15 
 
 
341 aa  292  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 
339 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.66 
 
 
341 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  46.25 
 
 
386 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.83 
 
 
332 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.11 
 
 
337 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.21 
 
 
344 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
338 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.83 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  46.57 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  41.52 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.36 
 
 
338 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.36 
 
 
338 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  46.53 
 
 
332 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  48.36 
 
 
338 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  42.09 
 
 
343 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
344 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.96 
 
 
338 aa  279  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  47.15 
 
 
332 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.25 
 
 
332 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  44.28 
 
 
332 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.25 
 
 
332 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.72 
 
 
345 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.25 
 
 
332 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.25 
 
 
332 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.25 
 
 
332 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.25 
 
 
332 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  46.15 
 
 
340 aa  275  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.74 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.25 
 
 
332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.12 
 
 
345 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 
337 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.12 
 
 
345 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  41.12 
 
 
345 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.12 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.12 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.12 
 
 
345 aa  272  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.12 
 
 
345 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  42.56 
 
 
345 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.56 
 
 
345 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  43.66 
 
 
342 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
346 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.14 
 
 
334 aa  269  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
345 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  48.63 
 
 
341 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  46.31 
 
 
340 aa  269  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  41.54 
 
 
345 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>