More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  100 
 
 
332 aa  670    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  64.07 
 
 
333 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  64.63 
 
 
334 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  65.24 
 
 
334 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.09 
 
 
349 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.54 
 
 
334 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  60.73 
 
 
335 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.49 
 
 
339 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.13 
 
 
334 aa  384  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  60.78 
 
 
343 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  59.16 
 
 
337 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  61.7 
 
 
341 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.12 
 
 
336 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  57.93 
 
 
336 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  58.36 
 
 
336 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  55.89 
 
 
339 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.4 
 
 
346 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  53.45 
 
 
341 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.54 
 
 
336 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.98 
 
 
338 aa  355  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.39 
 
 
340 aa  338  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  52.69 
 
 
334 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 
331 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.45 
 
 
337 aa  329  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 
332 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 
331 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.3 
 
 
337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.58 
 
 
338 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
337 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 
332 aa  328  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 
331 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 
331 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
332 aa  323  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  48.04 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.1 
 
 
334 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 
341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
337 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.54 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.55 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.15 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 
341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 
334 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.54 
 
 
340 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.61 
 
 
344 aa  301  7.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
339 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
349 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.45 
 
 
338 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.6 
 
 
338 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
331 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
335 aa  292  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.92 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.32 
 
 
341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
344 aa  287  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
332 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.11 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  47.46 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.12 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.13 
 
 
332 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  46.55 
 
 
341 aa  281  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.39 
 
 
345 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.32 
 
 
337 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.22 
 
 
336 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  45.78 
 
 
342 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.43 
 
 
332 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.81 
 
 
340 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.92 
 
 
336 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
344 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 
333 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  41.21 
 
 
331 aa  278  8e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.08 
 
 
345 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
338 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
341 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  46.13 
 
 
340 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 
341 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 
333 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  45.62 
 
 
336 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  44.88 
 
 
345 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  43.29 
 
 
334 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 
339 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.29 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.18 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.24 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  42.68 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  43.94 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.94 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 
338 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  41.87 
 
 
343 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
332 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.94 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
333 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
333 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.94 
 
 
345 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.65 
 
 
332 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.37 
 
 
338 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>