More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2563 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  82.48 
 
 		 332 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  80.36 
 
 		 332 aa  558  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  76.44 
 
 		 332 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  73.03 
 
 		 337 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.73 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  72.73 
 
 		 337 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  72.73 
 
 		 337 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  64.35 
 
 		 331 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  64.35 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  62.84 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  53.61 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 		 341 aa  335  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  48.34 
 
 		 331 aa  332  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  50.6 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.3 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  49.1 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  48.63 
 
 		 336 aa  315  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 		 334 aa  315  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.24 
 
 		 339 aa  315  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.2 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.89 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.25 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  47.31 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  47.13 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.85 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  43.9 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.29 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.07 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.11 
 
 		 345 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.25 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.37 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.99 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  41.92 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.91 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.87 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.24 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.7 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.51 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.33 
 
 		 332 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  48.02 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  41.92 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  43.67 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.51 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.32 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  46.39 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.69 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  45.07 
 
 		 348 aa  275  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.08 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.61 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  41.44 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.02 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.97 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.57 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.58 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.18 
 
 		 337 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.09 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.09 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  41.09 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.09 
 
 		 345 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.74 
 
 		 337 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.09 
 
 		 345 aa  265  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.79 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.79 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.09 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.61 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 		 349 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.18 
 
 		 342 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  44.18 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.05 
 
 		 341 aa  258  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.87 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.77 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  41.37 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>