More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  100 
 
 
339 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.66 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.88 
 
 
334 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.61 
 
 
340 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.75 
 
 
337 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  58.91 
 
 
335 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.09 
 
 
349 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  57.36 
 
 
334 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  55.29 
 
 
333 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  55.89 
 
 
332 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.53 
 
 
334 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  56.19 
 
 
334 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  58.63 
 
 
341 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  55.49 
 
 
336 aa  358  8e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.08 
 
 
339 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.6 
 
 
343 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  54.65 
 
 
336 aa  345  8.999999999999999e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  53.73 
 
 
337 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  51.65 
 
 
337 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  51.66 
 
 
331 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.59 
 
 
336 aa  329  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  51.66 
 
 
337 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.66 
 
 
337 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  51.35 
 
 
337 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.11 
 
 
338 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.52 
 
 
346 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
331 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.96 
 
 
334 aa  309  5e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.63 
 
 
332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
332 aa  301  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
334 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  46.85 
 
 
332 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
336 aa  295  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  47.13 
 
 
331 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  41.69 
 
 
331 aa  279  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.51 
 
 
344 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  44.48 
 
 
343 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
339 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.81 
 
 
340 aa  269  4e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.55 
 
 
332 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.14 
 
 
332 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
334 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
335 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  43.28 
 
 
334 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.28 
 
 
337 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  43.37 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
344 aa  262  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.13 
 
 
344 aa  262  6e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.79 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  44.24 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.78 
 
 
336 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.71 
 
 
341 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.44 
 
 
341 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
332 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
337 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.33 
 
 
342 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.77 
 
 
341 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
349 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
332 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  43.23 
 
 
340 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.88 
 
 
336 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  41.19 
 
 
345 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
342 aa  255  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.3 
 
 
345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.81 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.84 
 
 
345 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  43.2 
 
 
341 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
333 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
333 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.24 
 
 
333 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  42.99 
 
 
336 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 
333 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  40.65 
 
 
342 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.08 
 
 
338 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  40.7 
 
 
346 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.99 
 
 
335 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
333 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
333 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.94 
 
 
338 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.83 
 
 
338 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  40.95 
 
 
345 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  41.99 
 
 
386 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.09 
 
 
337 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
332 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.04 
 
 
334 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  41.42 
 
 
344 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
339 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  41.59 
 
 
348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.84 
 
 
345 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1603  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.51 
 
 
340 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.326802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>