More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6896 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
346 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.56 
 
 
336 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.56 
 
 
338 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  59.57 
 
 
334 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  59.27 
 
 
334 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.88 
 
 
349 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  59.09 
 
 
336 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.48 
 
 
339 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.13 
 
 
336 aa  364  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  56.4 
 
 
332 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  57.88 
 
 
341 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.48 
 
 
334 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  54.55 
 
 
333 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  54.1 
 
 
336 aa  341  9e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  53.19 
 
 
335 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.19 
 
 
334 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.81 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 
341 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  47.81 
 
 
337 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.06 
 
 
343 aa  325  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  51.52 
 
 
339 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
331 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.28 
 
 
337 aa  322  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
331 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  49.27 
 
 
341 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  51.52 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  47.75 
 
 
331 aa  311  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.4 
 
 
338 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.46 
 
 
340 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
332 aa  298  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 
334 aa  298  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 
332 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 
331 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  44.41 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  44.11 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 
339 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
331 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
337 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.84 
 
 
336 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  43.84 
 
 
336 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.24 
 
 
336 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.06 
 
 
340 aa  263  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
339 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.79 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.34 
 
 
332 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.96 
 
 
334 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.34 
 
 
337 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 
334 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.67 
 
 
332 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
335 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  39.33 
 
 
331 aa  252  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  38.35 
 
 
343 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.64 
 
 
333 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 
337 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.15 
 
 
338 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 
332 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  40.18 
 
 
386 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  43.11 
 
 
340 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
339 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
338 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.66 
 
 
332 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.3 
 
 
335 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.25 
 
 
338 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  43.79 
 
 
340 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
333 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
333 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
340 aa  246  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.39 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.36 
 
 
341 aa  245  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.98 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.26 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.22 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  40.18 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.98 
 
 
332 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.42 
 
 
345 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 
338 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.15 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.91 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.98 
 
 
332 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.98 
 
 
332 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.98 
 
 
332 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.98 
 
 
332 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
349 aa  242  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.6 
 
 
344 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 
338 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.12 
 
 
344 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.03 
 
 
334 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 
332 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
333 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.67 
 
 
332 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
341 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.17 
 
 
345 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>