More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2491 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  690    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  84.57 
 
 
338 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  83.09 
 
 
338 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  78.04 
 
 
338 aa  564  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  78.93 
 
 
339 aa  561  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  79.23 
 
 
338 aa  557  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  78.64 
 
 
338 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  77.15 
 
 
338 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  74.26 
 
 
339 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  70.36 
 
 
340 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.62 
 
 
337 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.96 
 
 
336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.96 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.93 
 
 
332 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  67.46 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  68.56 
 
 
332 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  68.86 
 
 
332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  66.47 
 
 
332 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.77 
 
 
337 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.97 
 
 
332 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  65.67 
 
 
332 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  66.17 
 
 
332 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  65.67 
 
 
332 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  65.67 
 
 
332 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  65.67 
 
 
332 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  65.67 
 
 
332 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.67 
 
 
332 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  64.97 
 
 
332 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.18 
 
 
337 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  51.18 
 
 
337 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.71 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.56 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.97 
 
 
345 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  48.55 
 
 
339 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  48.84 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 
335 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
346 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  48.39 
 
 
342 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  46.76 
 
 
343 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.02 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
331 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
341 aa  301  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.08 
 
 
349 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
331 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.66 
 
 
344 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.44 
 
 
341 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
339 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.66 
 
 
337 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  47.08 
 
 
354 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
337 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
337 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 
337 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  48.24 
 
 
340 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.12 
 
 
341 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
344 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
332 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 
332 aa  295  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.54 
 
 
338 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.61 
 
 
341 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  48.25 
 
 
345 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.61 
 
 
340 aa  294  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.2 
 
 
345 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 
345 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  50.29 
 
 
345 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  49.12 
 
 
348 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  46.2 
 
 
345 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  46.65 
 
 
344 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  46.2 
 
 
345 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.91 
 
 
345 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.91 
 
 
345 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.8 
 
 
338 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  48.25 
 
 
347 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.13 
 
 
341 aa  292  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.91 
 
 
345 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.2 
 
 
345 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  50.29 
 
 
345 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50 
 
 
345 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50 
 
 
345 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50 
 
 
345 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50 
 
 
345 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50 
 
 
345 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  46.33 
 
 
345 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.91 
 
 
345 aa  289  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 
338 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  45.7 
 
 
331 aa  288  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  46.2 
 
 
345 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  46.2 
 
 
345 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  46.2 
 
 
345 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 
332 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  46.2 
 
 
345 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  46.2 
 
 
345 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.45 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.16 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  46.36 
 
 
342 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.29 
 
 
349 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.75 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  45.32 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.27 
 
 
342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.12 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>