More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1816 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  95.5 
 
 		 333 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 		 333 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  93.39 
 
 		 333 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  99.1 
 
 		 333 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  81.63 
 
 		 334 aa  554  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  75.9 
 
 		 334 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  75.3 
 
 		 334 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  70.61 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  70.91 
 
 		 335 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.36 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.18 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.42 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.99 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  62.57 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 		 341 aa  332  8e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  48.51 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  51.19 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 		 340 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.9 
 
 		 344 aa  317  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  48.97 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.65 
 
 		 339 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.9 
 
 		 340 aa  315  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.07 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.96 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 332 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  46.88 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  47.9 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.55 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  45.1 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.73 
 
 		 345 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.07 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.2 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  48.37 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.77 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.43 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.73 
 
 		 345 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  46.13 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  46.13 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  47.51 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.7 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.7 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.83 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.83 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  46.75 
 
 		 336 aa  298  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.7 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  45.7 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  45.7 
 
 		 345 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 		 347 aa  298  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.43 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.91 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  49.4 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.45 
 
 		 336 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.94 
 
 		 469 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.15 
 
 		 336 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.51 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.94 
 
 		 479 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.94 
 
 		 427 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.94 
 
 		 406 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.79 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.18 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.06 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.88 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 346 aa  292  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.77 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.5 
 
 		 332 aa  291  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 338 aa  291  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.59 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.59 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.59 
 
 		 422 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.59 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  46.57 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.79 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  43.67 
 
 		 331 aa  289  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 		 343 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.61 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.81 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.34 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.91 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.34 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>