More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1585 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  99.7 
 
 		 331 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  680    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  88.82 
 
 		 331 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  64.35 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  64.94 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  64.13 
 
 		 337 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  64.13 
 
 		 337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  64.65 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.13 
 
 		 337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  63.14 
 
 		 332 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  63.83 
 
 		 337 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 		 341 aa  360  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  51.93 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.3 
 
 		 349 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.95 
 
 		 338 aa  331  9e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  50.45 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.81 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  50 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 		 334 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.65 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  49.55 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  49.55 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 		 341 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.19 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.89 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.27 
 
 		 337 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.95 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.18 
 
 		 339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  47.59 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.4 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.43 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.19 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.1 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.75 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  47.89 
 
 		 332 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  47.29 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.19 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.95 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  47.89 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.29 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.18 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.53 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.97 
 
 		 341 aa  288  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.31 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.05 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.75 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.99 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.58 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.18 
 
 		 332 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.75 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 		 332 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 		 339 aa  281  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.73 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  42.99 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  42.56 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  41.96 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  41.99 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.48 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.81 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.32 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 		 338 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.83 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  45.18 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.62 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.51 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.15 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 338 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.98 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.58 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  44.81 
 
 		 348 aa  268  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  44.18 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.58 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.58 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.58 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.58 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.94 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179819 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.58 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.58 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.88 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.35 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>