More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0428 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  676    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  64.71 
 
 
341 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
341 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  55.45 
 
 
337 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  55.45 
 
 
337 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.45 
 
 
337 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 
337 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 
331 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 
331 aa  361  8e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 
332 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  52.87 
 
 
332 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  53.5 
 
 
331 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  51.36 
 
 
332 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  51.96 
 
 
331 aa  346  4e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 
331 aa  345  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  54.85 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  53.94 
 
 
334 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
332 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.01 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
336 aa  331  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
341 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  50.6 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.51 
 
 
334 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 
334 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.35 
 
 
337 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  51.52 
 
 
336 aa  322  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.03 
 
 
339 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.87 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.54 
 
 
336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  50 
 
 
335 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.6 
 
 
336 aa  316  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  50 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  49.55 
 
 
339 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.91 
 
 
346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.25 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.04 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.35 
 
 
334 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
344 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.89 
 
 
337 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  44.34 
 
 
331 aa  299  6e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.37 
 
 
336 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.37 
 
 
336 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.88 
 
 
344 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  47.18 
 
 
336 aa  292  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.51 
 
 
340 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
337 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.51 
 
 
334 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.71 
 
 
340 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
339 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  47.02 
 
 
340 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
333 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
333 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
346 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.21 
 
 
332 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  47.16 
 
 
333 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.32 
 
 
338 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  46.73 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.48 
 
 
338 aa  285  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
338 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  47.55 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.15 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.81 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.96 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  42.77 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 
333 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
345 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.88 
 
 
338 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
345 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.96 
 
 
345 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.61 
 
 
344 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 
338 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 
338 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 
332 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.15 
 
 
332 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.57 
 
 
333 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.96 
 
 
345 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  46.57 
 
 
333 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.67 
 
 
345 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  41.67 
 
 
345 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
345 aa  279  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.67 
 
 
345 aa  279  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 
338 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.81 
 
 
332 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  46.29 
 
 
339 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.67 
 
 
345 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
342 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  42.06 
 
 
342 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 
338 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  42.11 
 
 
345 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  41.32 
 
 
343 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.84 
 
 
344 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 
349 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.83 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.83 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  40.53 
 
 
345 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.53 
 
 
345 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
339 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.53 
 
 
345 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 
341 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>