More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1933 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
332 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  94.58 
 
 
332 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  84.64 
 
 
332 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  76.51 
 
 
332 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.04 
 
 
337 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  76.81 
 
 
332 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.92 
 
 
336 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.92 
 
 
336 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  75 
 
 
332 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  75 
 
 
332 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  75 
 
 
332 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  75.3 
 
 
332 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  76.2 
 
 
332 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  75 
 
 
332 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  75 
 
 
332 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  75 
 
 
332 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  72.62 
 
 
336 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  71.77 
 
 
337 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.62 
 
 
338 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  68.14 
 
 
338 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  68.44 
 
 
338 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  67.26 
 
 
340 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  68.93 
 
 
338 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  68.36 
 
 
338 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  67.16 
 
 
339 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.49 
 
 
338 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  65.29 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.49 
 
 
338 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  53.71 
 
 
337 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.41 
 
 
337 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  49.7 
 
 
343 aa  328  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.34 
 
 
344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
341 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.68 
 
 
345 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 
344 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  50.74 
 
 
342 aa  322  7e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.68 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 
344 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  51.5 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.04 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  52.08 
 
 
348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
354 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.21 
 
 
345 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.21 
 
 
345 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
337 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.51 
 
 
344 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  48.51 
 
 
345 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.83 
 
 
342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  48.21 
 
 
345 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  48.21 
 
 
345 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.39 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.21 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  46.73 
 
 
346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  48.96 
 
 
344 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.21 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 
342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
342 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.92 
 
 
345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.21 
 
 
345 aa  305  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.7 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  47.02 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 
349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  48.2 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.2 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.11 
 
 
341 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  46.43 
 
 
342 aa  298  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.18 
 
 
341 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
347 aa  298  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  54.09 
 
 
345 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  54.09 
 
 
345 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.09 
 
 
345 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  54.09 
 
 
345 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  54.09 
 
 
345 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 
332 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  54.09 
 
 
345 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.8 
 
 
345 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.97 
 
 
334 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  47.29 
 
 
334 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  47.51 
 
 
340 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 
341 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  51.36 
 
 
340 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  50.15 
 
 
341 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  47.29 
 
 
331 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  47.29 
 
 
331 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.63 
 
 
342 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.51 
 
 
344 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>