More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0373 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
334 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  68.88 
 
 
339 aa  461  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.39 
 
 
340 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.37 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.26 
 
 
337 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.56 
 
 
349 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  58.13 
 
 
332 aa  384  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  57.23 
 
 
333 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.06 
 
 
336 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  54.22 
 
 
335 aa  362  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  54.65 
 
 
334 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  57.78 
 
 
337 aa  359  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.82 
 
 
334 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.39 
 
 
339 aa  352  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.21 
 
 
343 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  54.49 
 
 
336 aa  344  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  55.99 
 
 
341 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  53.43 
 
 
336 aa  331  8e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.19 
 
 
346 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.85 
 
 
338 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.25 
 
 
337 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  49.25 
 
 
337 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  49.25 
 
 
337 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 
331 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 
331 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
331 aa  309  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  48.65 
 
 
341 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
331 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 
332 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  46.49 
 
 
341 aa  298  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
332 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 
336 aa  293  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  48.35 
 
 
334 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
332 aa  291  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.78 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
339 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  40.36 
 
 
331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.4 
 
 
344 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  41.25 
 
 
343 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  42.9 
 
 
345 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.15 
 
 
345 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.69 
 
 
337 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  43.19 
 
 
345 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 
339 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  45.1 
 
 
340 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
344 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.56 
 
 
345 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.05 
 
 
340 aa  253  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.2 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
338 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
337 aa  252  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 
346 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.48 
 
 
338 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.86 
 
 
344 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 
335 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.78 
 
 
338 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  43.15 
 
 
347 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  41.86 
 
 
348 aa  248  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.47 
 
 
336 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 
349 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.45 
 
 
344 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 
342 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  40.61 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  40.7 
 
 
344 aa  245  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.66 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  39.76 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.59 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1603  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.12 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.326802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.07 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.54 
 
 
342 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  41.18 
 
 
336 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  42.43 
 
 
341 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  42.11 
 
 
342 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
341 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
342 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.79 
 
 
345 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 
341 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.87 
 
 
332 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.97 
 
 
341 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.19 
 
 
342 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.41 
 
 
345 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335343 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
345 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.18 
 
 
345 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  41.09 
 
 
345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  41.09 
 
 
345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  41.09 
 
 
345 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
339 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.6 
 
 
340 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
345 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.18 
 
 
345 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.79 
 
 
345 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.79 
 
 
345 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.88 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>