More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5754 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
343 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.8 
 
 
349 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  64.16 
 
 
334 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.2 
 
 
334 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  63.25 
 
 
334 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  61.14 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  60.48 
 
 
335 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.39 
 
 
336 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  59.3 
 
 
336 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  59.94 
 
 
333 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.41 
 
 
339 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  57.48 
 
 
336 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  60 
 
 
341 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  57.6 
 
 
339 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.74 
 
 
338 aa  355  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.21 
 
 
334 aa  355  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  57.35 
 
 
337 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.49 
 
 
346 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.19 
 
 
336 aa  339  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.95 
 
 
338 aa  338  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.98 
 
 
337 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  51.63 
 
 
341 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  48.98 
 
 
337 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  48.98 
 
 
337 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  48.69 
 
 
337 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.65 
 
 
340 aa  329  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  50.43 
 
 
341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 
337 aa  316  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
332 aa  316  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.07 
 
 
334 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
332 aa  305  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
331 aa  301  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
331 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  45.7 
 
 
331 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.27 
 
 
332 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
331 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.38 
 
 
340 aa  291  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
339 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  47.49 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.07 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  48.55 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.2 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
338 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.47 
 
 
336 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.18 
 
 
336 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  43.03 
 
 
343 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.12 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  45.43 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
331 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  43.53 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  43.53 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.53 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.53 
 
 
345 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.53 
 
 
345 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.24 
 
 
345 aa  271  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.54 
 
 
337 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  42.04 
 
 
331 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.21 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  42.82 
 
 
345 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 
344 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.31 
 
 
341 aa  268  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.65 
 
 
345 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
335 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.99 
 
 
344 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.81 
 
 
332 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.48 
 
 
333 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
333 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.92 
 
 
341 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
333 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
337 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  41.95 
 
 
345 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.58 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.73 
 
 
338 aa  262  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
342 aa  262  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  47.21 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 
346 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  44.01 
 
 
334 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 
341 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  43.71 
 
 
334 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
347 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.86 
 
 
335 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.53 
 
 
342 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.47 
 
 
341 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.63 
 
 
338 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
344 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.2 
 
 
341 aa  258  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.24 
 
 
345 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.24 
 
 
345 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.18 
 
 
332 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  42.94 
 
 
345 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.94 
 
 
345 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.24 
 
 
344 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 
345 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.48 
 
 
345 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  42.94 
 
 
345 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 
341 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>