More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1837 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  91.34 
 
 		 386 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 		 335 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  76.65 
 
 		 334 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  72.42 
 
 		 333 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  70.91 
 
 		 333 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  71.21 
 
 		 333 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  70.61 
 
 		 333 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  69.16 
 
 		 334 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  69.3 
 
 		 334 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.42 
 
 		 335 aa  434  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.88 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.89 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.28 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  60.78 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.41 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.25 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.29 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  46.76 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.59 
 
 		 339 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 		 332 aa  305  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.32 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  47.32 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  46.36 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.65 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.65 
 
 		 422 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.35 
 
 		 469 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  48.52 
 
 		 339 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.65 
 
 		 338 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  45.64 
 
 		 340 aa  301  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 344 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.91 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.35 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.35 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.45 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.35 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.35 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.13 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  45.77 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 		 332 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.53 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.88 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.49 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.07 
 
 		 338 aa  291  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.36 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  46.06 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.02 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.01 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  45.62 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  45.62 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.83 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.97 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 		 337 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  45.86 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.41 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  43.71 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.08 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2983  hypothetical protein  45.37 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.5 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.11 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.65 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.37 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.81 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.68 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  45.16 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  42.81 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  42.81 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 		 344 aa  279  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  47.01 
 
 		 347 aa  278  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 332 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.11 
 
 		 345 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.11 
 
 		 345 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  43.11 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.11 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  42.81 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.11 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>