More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1674 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  678    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2060  alcohol dehydrogenase  72.29 
 
 
332 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.881671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2403  alcohol dehydrogenase  67.77 
 
 
332 aa  478  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03835  predicted NADP-dependent oxidoreductase  66.87 
 
 
332 aa  477  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0444273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  58.79 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  47.13 
 
 
332 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.68 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
335 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  43.43 
 
 
334 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  42.81 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  43.56 
 
 
333 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.17 
 
 
333 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
333 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
340 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.17 
 
 
337 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.79 
 
 
334 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
344 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
339 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
337 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.64 
 
 
337 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.09 
 
 
344 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
332 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.69 
 
 
345 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 
337 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  44.11 
 
 
331 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.8 
 
 
335 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
332 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
332 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.73 
 
 
344 aa  255  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  39.88 
 
 
386 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
422 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.6 
 
 
338 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.84 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
469 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
338 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
427 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.9 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.14 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 
339 aa  252  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
339 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
346 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
339 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  41.99 
 
 
338 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  39.65 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  43.47 
 
 
331 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
336 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  40.06 
 
 
343 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  43.47 
 
 
331 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
336 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
354 aa  249  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.46 
 
 
332 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  40 
 
 
345 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
343 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
332 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.91 
 
 
349 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  42.26 
 
 
336 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.27 
 
 
345 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.25 
 
 
339 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.27 
 
 
345 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.08 
 
 
332 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
332 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.58 
 
 
345 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.08 
 
 
332 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 
332 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
338 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
338 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
338 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.27 
 
 
345 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
345 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
337 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1147  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
364 aa  245  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145714  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  38.97 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.77 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.77 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  38.97 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.77 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.46 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  42.77 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.77 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.46 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.46 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
338 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.01 
 
 
340 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
338 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.54 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  39.36 
 
 
344 aa  242  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 
341 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.12 
 
 
338 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.65 
 
 
338 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 
344 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 
342 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>