More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0265 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  93.67 
 
 
332 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  72.95 
 
 
332 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15660  oxidoreductase  59.88 
 
 
331 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446375  hitchhiker  1.47044e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 
335 aa  311  9e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.66 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  48.5 
 
 
333 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.2 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  47.9 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.66 
 
 
338 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
338 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
338 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
338 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.95 
 
 
347 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.24 
 
 
334 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  46.55 
 
 
334 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  46.71 
 
 
333 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.16 
 
 
344 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
344 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  46.25 
 
 
334 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.27 
 
 
335 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
338 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.6 
 
 
341 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
340 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
338 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  46.06 
 
 
386 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.15 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.48 
 
 
338 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.21 
 
 
334 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.88 
 
 
338 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.88 
 
 
422 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.88 
 
 
469 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.88 
 
 
338 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.1 
 
 
337 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.88 
 
 
406 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.88 
 
 
479 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.88 
 
 
427 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  43.15 
 
 
343 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  47.02 
 
 
339 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.24 
 
 
345 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  50.45 
 
 
334 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.78 
 
 
340 aa  276  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.08 
 
 
336 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  45.7 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.94 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.7 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.21 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.48 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.61 
 
 
332 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.4 
 
 
338 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
334 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.95 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.86 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  43.32 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
338 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  43.79 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  42.43 
 
 
345 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.41 
 
 
332 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
332 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.76 
 
 
345 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.76 
 
 
345 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.76 
 
 
345 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  44.05 
 
 
335 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.76 
 
 
345 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.74 
 
 
338 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.76 
 
 
345 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 
342 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
344 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.46 
 
 
345 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 
344 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4427  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.88 
 
 
335 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.58 
 
 
349 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  47.16 
 
 
345 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 
341 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
342 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.05 
 
 
342 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.61 
 
 
332 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 
346 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  44.21 
 
 
340 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.18 
 
 
340 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 
341 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  45.21 
 
 
341 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
347 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
341 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
337 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.32 
 
 
341 aa  258  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
338 aa  258  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.61 
 
 
332 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>