More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3516 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3516  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
340 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  48.39 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.57 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  48.41 
 
 
338 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.41 
 
 
338 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  48.41 
 
 
338 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  48.7 
 
 
338 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  48.7 
 
 
338 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.12 
 
 
338 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.8 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.21 
 
 
338 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.92 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.21 
 
 
406 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.21 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  46.92 
 
 
422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  43.53 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.21 
 
 
469 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  47.21 
 
 
479 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  45.38 
 
 
344 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  42.4 
 
 
334 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.11 
 
 
335 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.27 
 
 
344 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.81 
 
 
337 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  43.6 
 
 
340 aa  255  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  40.94 
 
 
386 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  42.27 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 
332 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.69 
 
 
334 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.57 
 
 
344 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  42.35 
 
 
333 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.7 
 
 
339 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.18 
 
 
347 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
333 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  43.11 
 
 
336 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.76 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.07 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
332 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.76 
 
 
338 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  41.98 
 
 
345 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 
333 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 
338 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.53 
 
 
341 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.76 
 
 
345 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.56 
 
 
336 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 
346 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.36 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  39.53 
 
 
345 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  42.73 
 
 
340 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
345 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.53 
 
 
345 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  39.53 
 
 
345 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.53 
 
 
345 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 
338 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 
342 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
347 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.89 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.53 
 
 
345 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.23 
 
 
345 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.23 
 
 
345 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  40.87 
 
 
339 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.47 
 
 
342 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 
344 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
338 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.59 
 
 
345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.59 
 
 
345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.29 
 
 
345 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  40.29 
 
 
345 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  40.29 
 
 
345 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.66 
 
 
338 aa  235  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.23 
 
 
345 aa  235  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  40.4 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.94 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.61 
 
 
332 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 
339 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  42.06 
 
 
339 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 
338 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.08 
 
 
342 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
332 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  41.56 
 
 
353 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  37.57 
 
 
343 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.23 
 
 
338 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  43.9 
 
 
341 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.61 
 
 
332 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
341 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.91 
 
 
341 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
341 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.21 
 
 
341 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.91 
 
 
334 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
340 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
335 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>