More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6181 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
338 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  57.74 
 
 
337 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.44 
 
 
337 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  54.73 
 
 
339 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  54.65 
 
 
344 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.06 
 
 
338 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.06 
 
 
338 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  55.49 
 
 
339 aa  361  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  56.46 
 
 
338 aa  359  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.55 
 
 
345 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  52.55 
 
 
345 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.55 
 
 
345 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.55 
 
 
345 aa  348  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.1 
 
 
344 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  52.55 
 
 
345 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.55 
 
 
345 aa  348  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5815  quinone oxidoreductase  55.03 
 
 
341 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  52.25 
 
 
345 aa  348  8e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  52.25 
 
 
345 aa  348  8e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  54.68 
 
 
340 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  51.93 
 
 
345 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.25 
 
 
345 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.82 
 
 
345 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  52.25 
 
 
345 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  51.63 
 
 
345 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.94 
 
 
344 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  51.34 
 
 
346 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.78 
 
 
341 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4367  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.25 
 
 
344 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  51.49 
 
 
342 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  50.59 
 
 
343 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  51.18 
 
 
344 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.78 
 
 
341 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.6 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.79 
 
 
344 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  52.87 
 
 
341 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.1 
 
 
344 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.11 
 
 
342 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  49.11 
 
 
342 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
354 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.29 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.96 
 
 
345 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.96 
 
 
345 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.66 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  48.66 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4220  alcohol dehydrogenase  51.93 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  48.66 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  53.12 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.78 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  50.45 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1275  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.71 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.71 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0318  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.71 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0259  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.71 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1691  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  53.71 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.415717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0106  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  53.71 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
349 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.84 
 
 
342 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  49.56 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1778  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  53.41 
 
 
345 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.93 
 
 
341 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4293  alcohol dehydrogenase  51.46 
 
 
352 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3825  alcohol dehydrogenase  51.75 
 
 
352 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1605  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.58 
 
 
352 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954411  normal  0.13254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.97 
 
 
341 aa  315  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5953  alcohol dehydrogenase  50.88 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95038  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3963  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.17 
 
 
352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4404  alcohol dehydrogenase  51.17 
 
 
352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  48.52 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  47.21 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  48.96 
 
 
347 aa  301  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.99 
 
 
336 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.99 
 
 
336 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  45.16 
 
 
336 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.31 
 
 
337 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
340 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.83 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4427  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.77 
 
 
335 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.61 
 
 
337 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.18 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.64 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.21 
 
 
334 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
334 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  44.61 
 
 
332 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 
335 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.2 
 
 
334 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.21 
 
 
335 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.83 
 
 
332 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  43.32 
 
 
334 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.7 
 
 
332 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.92 
 
 
386 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.98 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  43.03 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.42 
 
 
341 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>