More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0941 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  94.15 
 
 
427 aa  746    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  99.7 
 
 
338 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  100 
 
 
406 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  98 
 
 
479 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  97.63 
 
 
338 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  99.41 
 
 
338 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  98 
 
 
469 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  98.76 
 
 
422 aa  745    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  85.8 
 
 
338 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  85.21 
 
 
338 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  85.21 
 
 
338 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  85.21 
 
 
338 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  85.8 
 
 
338 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  85.5 
 
 
338 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  55.92 
 
 
340 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  48.67 
 
 
334 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.94 
 
 
335 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  47.65 
 
 
386 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  46.9 
 
 
334 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.63 
 
 
341 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.38 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.66 
 
 
333 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.34 
 
 
339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 
333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  48.37 
 
 
332 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
332 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
335 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
344 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.93 
 
 
347 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3516  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.21 
 
 
340 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.87 
 
 
341 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  43.86 
 
 
339 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
347 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 
341 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.31 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1095  alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
354 aa  269  8e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 
343 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.23 
 
 
344 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.83 
 
 
345 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1147  alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 
364 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145714  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 
337 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  42.61 
 
 
345 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
340 aa  262  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
339 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
339 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  43.39 
 
 
344 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.78 
 
 
332 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.55 
 
 
345 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 
334 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 
337 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.97 
 
 
347 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.37 
 
 
344 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.75 
 
 
338 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
332 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 
334 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  42.73 
 
 
353 aa  256  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
344 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 
334 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  44.9 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.37 
 
 
332 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.76 
 
 
338 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2244  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
338 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381714  normal  0.404773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.43 
 
 
338 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  40.87 
 
 
345 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
338 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.22 
 
 
336 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.83 
 
 
345 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 
338 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 
339 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2983  hypothetical protein  41.74 
 
 
332 aa  249  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.16 
 
 
344 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.92 
 
 
336 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.75 
 
 
338 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 
349 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.83 
 
 
345 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.83 
 
 
345 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.33 
 
 
358 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.94 
 
 
337 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 
340 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.01 
 
 
334 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.84 
 
 
338 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.05 
 
 
339 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.31 
 
 
342 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  39.4 
 
 
331 aa  246  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
342 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  40.53 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.53 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  42.35 
 
 
340 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 
346 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  40.53 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.77 
 
 
332 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  42.34 
 
 
332 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>