More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2718 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
339 aa  685    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  98.82 
 
 
343 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
339 aa  685    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  83.08 
 
 
339 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  81.33 
 
 
347 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  48.49 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  47.59 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.32 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  47.32 
 
 
386 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 
344 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
340 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.02 
 
 
334 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 
333 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.64 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.77 
 
 
347 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 
333 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
333 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.28 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.92 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45 
 
 
347 aa  281  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  45.3 
 
 
353 aa  278  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.24 
 
 
341 aa  265  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.37 
 
 
338 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
338 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
338 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
338 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.77 
 
 
341 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
340 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
469 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
427 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
406 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
479 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.91 
 
 
338 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
422 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 
334 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.61 
 
 
338 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
338 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
338 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.77 
 
 
334 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
344 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.3 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.12 
 
 
344 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.81 
 
 
332 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
332 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2983  hypothetical protein  42.94 
 
 
332 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  43.62 
 
 
332 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  43.41 
 
 
332 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  40.83 
 
 
331 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
345 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.88 
 
 
342 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.35 
 
 
345 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 
332 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 
341 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  40 
 
 
344 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
332 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.64 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
339 aa  246  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.86 
 
 
332 aa  245  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.8 
 
 
358 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1405  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
341 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  41.06 
 
 
337 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.37 
 
 
340 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  38.42 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  38.46 
 
 
345 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  38.46 
 
 
345 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  41.59 
 
 
347 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  41.23 
 
 
348 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  43.82 
 
 
339 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
342 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
339 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.24 
 
 
346 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03835  predicted NADP-dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
332 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0444273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  42.9 
 
 
336 aa  235  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
349 aa  235  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.14 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.01 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2060  alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.881671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  42.77 
 
 
340 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
339 aa  232  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.18 
 
 
338 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
346 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.76 
 
 
345 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.69 
 
 
345 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.08 
 
 
332 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.08 
 
 
332 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.77 
 
 
338 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.08 
 
 
332 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
345 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.08 
 
 
332 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
338 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  41.47 
 
 
340 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
330 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  43.58 
 
 
332 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 
347 aa  229  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>