More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3116 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
270 aa  553  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
256 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
266 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.54 
 
 
253 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
267 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
264 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
259 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
264 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
259 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
250 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.2 
 
 
257 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
255 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
253 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.3 
 
 
257 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
257 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
267 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
249 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
267 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
267 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
252 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
259 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  30.24 
 
 
261 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
257 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
265 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
261 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  29.5 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  29.5 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  28.46 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.01 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1484  short chain dehydrogenase  32 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  28.06 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.19 
 
 
266 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 
277 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
262 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
277 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
259 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
262 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
271 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 
344 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.65 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
343 aa  89.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.46 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
266 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 
266 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.18 
 
 
360 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.84 
 
 
282 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  27.13 
 
 
267 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
269 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  26.72 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>