More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8408 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
252 aa  280  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.71 
 
 
250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.89 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
259 aa  251  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
253 aa  244  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  57.32 
 
 
253 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 
269 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
269 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
263 aa  229  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
251 aa  228  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  49.38 
 
 
249 aa  224  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
255 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.74 
 
 
282 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
258 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  49.58 
 
 
296 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
259 aa  208  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
258 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
259 aa  201  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  49.01 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
276 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19470  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.53 
 
 
287 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
266 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
270 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
265 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 
258 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
265 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  40.71 
 
 
267 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
263 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
263 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
267 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  41.85 
 
 
264 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
262 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
266 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
263 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
257 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
277 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
264 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
265 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
267 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
264 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
262 aa  148  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
260 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
272 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
266 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  40.98 
 
 
265 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
269 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 
265 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
264 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
256 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
266 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
261 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.07 
 
 
265 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  35.94 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.07 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  40.98 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
261 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
260 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
264 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.5 
 
 
258 aa  138  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
259 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
262 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
283 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.35 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
273 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
291 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
261 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
262 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
258 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>