More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2661 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2661  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 289 aa  590  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5461  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.151459  normal  0.0638444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  24.09 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  25.71 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  25.33 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4244  LysR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.291884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  28.29 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.02 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0241  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.59 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1769  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0244764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  26.24 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  21.92 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  21.28 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  27.32 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  25.7 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.56 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0678  HTH-type transciptional regulator, LysR-family  25.47 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0849029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  24 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0429  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0398764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  24.7 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  25.3 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.69 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  26.29 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  27.75 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4974  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  28.09 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  28.09 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  24.83 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  24.05 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  24.05 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0660  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.32 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0811  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>