198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0773 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.224338  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2016  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.64326  normal  0.538375 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  25.89 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  26.25 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  23.77 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  22.92 
 
 
323 aa  62.4  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0004  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  23.77 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  23.93 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.75 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
331 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  22.29 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.44 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.99 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.29 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.29 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.29 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.29 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  25.26 
 
 
694 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.23 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  22.32 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.744815  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
287 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  21.98 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 
321 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  20.81 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.93 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.19 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.53 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.67 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.02 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0710  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.97 
 
 
337 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.36 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  22.87 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.42 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.07 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.39 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  26.94 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.33 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.96 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00302715  hitchhiker  0.000000109049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.6 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.53 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
331 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.36 
 
 
342 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  23.84 
 
 
389 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  22.7 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.99 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.28 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.11 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.15 
 
 
506 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4056  dehydrogenase, putative  21.89 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  25.58 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.9 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.24 
 
 
508 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  25.11 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  23.12 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  23.12 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.31 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.26 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  30.39 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.32 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1062  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.54 
 
 
321 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  29.21 
 
 
307 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  22.22 
 
 
335 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  22.08 
 
 
338 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
309 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.15 
 
 
320 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0398  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  28.25 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  29.19 
 
 
205 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>