78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1031 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.64326  normal  0.538375 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2016  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73 
 
 		 306 aa  448  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.1 
 
 		 300 aa  402  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0004  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.88 
 
 		 300 aa  394  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.744815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.224338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  28.5 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  24.42 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  25.97 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  23.97 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.38 
 
 		 508 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  26.36 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  27.06 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  25.91 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  30.58 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.78 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  26.88 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  27.03 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.32 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0714  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.24 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  27.8 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105028  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18610  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.27 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  25.83 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.73 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  33.78 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17671  predicted protein  23.08 
 
 		 397 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.48 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  24.81 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  32.67 
 
 		 430 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4601  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.65 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  28.96 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  29.65 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>