30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0434 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 313 aa  639    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.744815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2016  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.64326  normal  0.538375 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0004  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.3 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  26.11 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  24.9 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.11 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.224338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18610  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.16 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  26.24 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.46 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  24.38 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  24.37 
 
 		 304 aa  45.8  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.96 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.96 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.89 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>