More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0676 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
537 aa  1098    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  61.06 
 
 
535 aa  686    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.72 
 
 
546 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.83 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.32 
 
 
560 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.32 
 
 
560 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 
546 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.39 
 
 
560 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.13 
 
 
560 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.17 
 
 
560 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.4 
 
 
548 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.36 
 
 
560 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.36 
 
 
560 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.8 
 
 
560 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  42.8 
 
 
548 aa  419  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 
546 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.34 
 
 
545 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 
547 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.54 
 
 
560 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.64 
 
 
560 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 
547 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 
546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 
553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.35 
 
 
550 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
563 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.38 
 
 
548 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.43 
 
 
548 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.62 
 
 
545 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.24 
 
 
548 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.33 
 
 
552 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 
546 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 
548 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
564 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  38.55 
 
 
564 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 
548 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
556 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
554 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
556 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  37.61 
 
 
556 aa  378  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 
559 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 
555 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 
559 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 
601 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 
601 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 
601 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 
601 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 
601 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
601 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
544 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 
537 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 
537 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 
537 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 
537 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 
537 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 
537 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 
537 aa  329  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 
537 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 
533 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 
537 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 
542 aa  326  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 
537 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
544 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
539 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
527 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.96 
 
 
541 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.47 
 
 
542 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.96 
 
 
534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 
552 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 
549 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.71 
 
 
542 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
550 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  35.1 
 
 
546 aa  313  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
544 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.71 
 
 
547 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.71 
 
 
542 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  35.3 
 
 
542 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
546 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
546 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  37.07 
 
 
545 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.46 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.35 
 
 
538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 
565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 
584 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
546 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.39 
 
 
569 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.39 
 
 
569 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 
547 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.21 
 
 
547 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  35.01 
 
 
534 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 
543 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 
543 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
542 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 
552 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 
543 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
547 aa  300  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
699 aa  300  6e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>