More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1061 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  62.14 
 
 		 553 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 601 aa  1201    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 601 aa  1201    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  55.93 
 
 		 548 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.83 
 
 		 601 aa  1200    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  56.6 
 
 		 548 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 601 aa  1201    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 601 aa  1201    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  99.67 
 
 		 601 aa  1197    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  53.68 
 
 		 554 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  53.17 
 
 		 547 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  52.68 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  52.84 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  52.68 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  48.65 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.35 
 
 		 560 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  44.85 
 
 		 546 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.53 
 
 		 552 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.31 
 
 		 546 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.35 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.34 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  48.36 
 
 		 546 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.34 
 
 		 560 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.9 
 
 		 545 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.8 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.12 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.12 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.69 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.16 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.12 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.69 
 
 		 560 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.61 
 
 		 560 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.49 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.75 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 556 aa  475  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.38 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.03 
 
 		 548 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  42.35 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.61 
 
 		 548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  40.27 
 
 		 564 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  42.06 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  40.1 
 
 		 564 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 548 aa  339  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 547 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 		 546 aa  335  2e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.84 
 
 		 537 aa  332  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 537 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 537 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 537 aa  328  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.5 
 
 		 537 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 544 aa  323  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 539 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 544 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 542 aa  309  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  34.69 
 
 		 534 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 533 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 558 aa  300  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  33.16 
 
 		 542 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 537 aa  297  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  34.07 
 
 		 542 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 557 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  32.65 
 
 		 542 aa  292  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.63 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  33.5 
 
 		 542 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  32.88 
 
 		 542 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.47 
 
 		 558 aa  290  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 546 aa  290  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.53 
 
 		 542 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  33.22 
 
 		 542 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.36 
 
 		 542 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 		 538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 544 aa  287  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 552 aa  287  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 		 541 aa  287  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  32.02 
 
 		 546 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2922  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 554 aa  283  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.933467  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 549 aa  282  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  34.41 
 
 		 545 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 575 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 549 aa  280  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 		 546 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 		 545 aa  277  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 545 aa  276  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0471179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2557  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 555 aa  276  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.65 
 
 		 545 aa  276  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.13 
 
 		 569 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 545 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>