More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0570 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.52 
 
 		 550 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.45 
 
 		 545 aa  675    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.9 
 
 		 548 aa  695    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  65.75 
 
 		 548 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.54 
 
 		 548 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  58.16 
 
 		 546 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.03 
 
 		 545 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 546 aa  1133    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.46 
 
 		 552 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  55.39 
 
 		 547 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  53.43 
 
 		 548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.87 
 
 		 560 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.06 
 
 		 560 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  54.71 
 
 		 554 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.86 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  53.68 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  53.86 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  53.49 
 
 		 559 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.34 
 
 		 546 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.02 
 
 		 560 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.34 
 
 		 546 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.83 
 
 		 560 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.02 
 
 		 560 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.83 
 
 		 560 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.22 
 
 		 548 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.56 
 
 		 560 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  51.21 
 
 		 553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  52.31 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  52.51 
 
 		 546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.67 
 
 		 560 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.83 
 
 		 560 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  48.06 
 
 		 556 aa  528  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  47.88 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  47.7 
 
 		 556 aa  521  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  49.45 
 
 		 563 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 		 564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.85 
 
 		 601 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.85 
 
 		 601 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  47.99 
 
 		 564 aa  513  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.85 
 
 		 601 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.85 
 
 		 601 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  45.02 
 
 		 601 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.67 
 
 		 601 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 		 537 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  42.21 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 546 aa  402  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.38 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40 
 
 		 537 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.58 
 
 		 537 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 537 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 		 553 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 546 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.38 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 537 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 537 aa  363  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 537 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 		 533 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 540 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.27 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 		 539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 586 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 549 aa  353  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 551 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.36 
 
 		 541 aa  346  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 552 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 527 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  36.03 
 
 		 546 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 549 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 539 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 538 aa  342  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  36.48 
 
 		 534 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  35.69 
 
 		 542 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 		 557 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 		 542 aa  340  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 		 534 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 550 aa  340  5e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  36.72 
 
 		 542 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 549 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  36.48 
 
 		 542 aa  339  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 551 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 536 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 552 aa  336  7e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  36.33 
 
 		 542 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 		 545 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  36.15 
 
 		 542 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 		 556 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.84 
 
 		 546 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 558 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.84 
 
 		 546 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>