More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0898 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  100 
 
 		 556 aa  1157    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  60.87 
 
 		 564 aa  714    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  61.05 
 
 		 564 aa  714    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  97.66 
 
 		 556 aa  1103    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  73.92 
 
 		 556 aa  882    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.19 
 
 		 546 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.72 
 
 		 560 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  49 
 
 		 548 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.72 
 
 		 560 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.08 
 
 		 560 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.27 
 
 		 546 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.65 
 
 		 550 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.37 
 
 		 552 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.17 
 
 		 560 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.1 
 
 		 548 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  47.72 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  48.8 
 
 		 546 aa  529  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.74 
 
 		 545 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.55 
 
 		 560 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51 
 
 		 560 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.82 
 
 		 560 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 560 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 547 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  47.73 
 
 		 553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.91 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  48.9 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  48.72 
 
 		 559 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  47.7 
 
 		 546 aa  511  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  48.72 
 
 		 559 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 548 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 		 554 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.05 
 
 		 560 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.91 
 
 		 548 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.52 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.72 
 
 		 548 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  47.16 
 
 		 563 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.23 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  44.28 
 
 		 546 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  42.4 
 
 		 601 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 537 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 		 537 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.29 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.29 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.11 
 
 		 537 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.11 
 
 		 537 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.38 
 
 		 537 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.11 
 
 		 537 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 546 aa  345  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 550 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 542 aa  343  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 544 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 545 aa  339  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.64 
 
 		 546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 537 aa  336  7.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.68 
 
 		 545 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 		 545 aa  334  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 533 aa  332  9e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.45 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.56 
 
 		 543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.56 
 
 		 543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.26 
 
 		 542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.56 
 
 		 543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 552 aa  327  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 527 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 558 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 552 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.55 
 
 		 545 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 549 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.65 
 
 		 547 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 		 545 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 544 aa  320  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.21 
 
 		 556 aa  320  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 586 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 542 aa  320  6e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.18 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 551 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 546 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 547 aa  316  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>