More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1168 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  60.87 
 
 		 556 aa  690    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  100 
 
 		 564 aa  1175    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  93.44 
 
 		 564 aa  1111    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  61.05 
 
 		 556 aa  694    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  61.45 
 
 		 556 aa  718    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.54 
 
 		 560 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.45 
 
 		 560 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.27 
 
 		 560 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 560 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.55 
 
 		 560 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.62 
 
 		 546 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.55 
 
 		 560 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.55 
 
 		 560 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.54 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 		 560 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  49.1 
 
 		 547 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 		 560 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.37 
 
 		 560 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.27 
 
 		 552 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  48.35 
 
 		 548 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  47.71 
 
 		 546 aa  519  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  47.89 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.17 
 
 		 548 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  45.21 
 
 		 553 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.36 
 
 		 550 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.7 
 
 		 545 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  47.99 
 
 		 546 aa  490  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  46.29 
 
 		 559 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  47.35 
 
 		 563 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  46.29 
 
 		 559 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  46.74 
 
 		 555 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.26 
 
 		 548 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.73 
 
 		 548 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.73 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.69 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  44.83 
 
 		 546 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.1 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.1 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.1 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  40.27 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.1 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.1 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 537 aa  382  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 547 aa  364  2e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 542 aa  359  9e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 552 aa  346  7e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 551 aa  344  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 		 545 aa  342  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.56 
 
 		 537 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 		 537 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.93 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 540 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.05 
 
 		 545 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 537 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 539 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 550 aa  334  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.38 
 
 		 537 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 537 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 537 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.05 
 
 		 545 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 537 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 537 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 558 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.56 
 
 		 537 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.12 
 
 		 542 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 575 aa  329  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 		 542 aa  329  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 547 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 		 556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2932  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0465511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 544 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 527 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 537 aa  326  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 		 542 aa  326  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.47 
 
 		 542 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 		 542 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 552 aa  325  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 		 541 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 549 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 		 546 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.23 
 
 		 542 aa  324  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.14 
 
 		 545 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 		 546 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.26 
 
 		 560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 		 546 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>