More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5028 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  86.82 
 
 		 554 aa  946    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  99.28 
 
 		 555 aa  1107    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 559 aa  1126    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  99.82 
 
 		 559 aa  1123    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  63.17 
 
 		 546 aa  673    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  58.46 
 
 		 547 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.35 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.22 
 
 		 552 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.83 
 
 		 548 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.54 
 
 		 545 aa  589  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  53.8 
 
 		 546 aa  591  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  53.96 
 
 		 548 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  54.68 
 
 		 548 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  54.95 
 
 		 553 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.86 
 
 		 548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  56.93 
 
 		 546 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.8 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.68 
 
 		 548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.79 
 
 		 546 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.59 
 
 		 560 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.16 
 
 		 560 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.7 
 
 		 560 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.97 
 
 		 560 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.6 
 
 		 560 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.24 
 
 		 560 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.6 
 
 		 560 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.92 
 
 		 545 aa  551  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.69 
 
 		 560 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  52.84 
 
 		 601 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.68 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.51 
 
 		 601 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.68 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.68 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.68 
 
 		 601 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  49 
 
 		 556 aa  538  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.78 
 
 		 560 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.2 
 
 		 560 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 548 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  48.72 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  48.72 
 
 		 556 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  46.47 
 
 		 564 aa  514  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  46.29 
 
 		 564 aa  510  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  49.36 
 
 		 563 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 535 aa  405  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 547 aa  392  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  41.93 
 
 		 527 aa  359  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 552 aa  349  7e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 542 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2557  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 546 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 558 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 539 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.86 
 
 		 537 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4136  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 587 aa  320  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.33 
 
 		 545 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.05 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.68 
 
 		 537 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2922  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 554 aa  316  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.933467  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 544 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 537 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 537 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.5 
 
 		 537 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 537 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 537 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.42 
 
 		 549 aa  313  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 537 aa  312  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 552 aa  312  9e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.68 
 
 		 537 aa  312  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 537 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 553 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.2 
 
 		 543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 538 aa  306  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 		 545 aa  304  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 542 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 550 aa  302  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.4 
 
 		 538 aa  302  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 575 aa  299  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 533 aa  299  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 549 aa  299  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 547 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.63 
 
 		 542 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 586 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 565 aa  298  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>