More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1673 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  84.64 
 
 		 548 aa  978    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 547 aa  1107    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  80.95 
 
 		 546 aa  944    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  45.67 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.86 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.21 
 
 		 548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.21 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 		 563 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  43.12 
 
 		 544 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 		 546 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.94 
 
 		 545 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  39.67 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.15 
 
 		 548 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  41.64 
 
 		 547 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 555 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 559 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.13 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.63 
 
 		 560 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.48 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.31 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.37 
 
 		 548 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.3 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.34 
 
 		 560 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  41.24 
 
 		 544 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.79 
 
 		 560 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.81 
 
 		 560 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  36.85 
 
 		 564 aa  364  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 537 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 548 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38 
 
 		 537 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 		 556 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 		 549 aa  363  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 		 537 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  38.41 
 
 		 556 aa  361  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.61 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 564 aa  361  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 		 537 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.69 
 
 		 560 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 586 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.42 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.77 
 
 		 545 aa  356  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.86 
 
 		 541 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 550 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 558 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  37.48 
 
 		 542 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 		 565 aa  353  5.9999999999999994e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 546 aa  352  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  38.87 
 
 		 542 aa  352  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 545 aa  352  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 533 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.57 
 
 		 545 aa  350  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  37.36 
 
 		 542 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.81 
 
 		 547 aa  349  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 542 aa  349  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  37.27 
 
 		 542 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 551 aa  349  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.34 
 
 		 542 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 		 542 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.25 
 
 		 560 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 538 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  36.46 
 
 		 542 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  38.32 
 
 		 534 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 542 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  37.77 
 
 		 546 aa  344  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 		 534 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.95 
 
 		 543 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.95 
 
 		 543 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.95 
 
 		 543 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 544 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  37.92 
 
 		 545 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.61 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 557 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  38.95 
 
 		 540 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  37.16 
 
 		 542 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>