More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2120 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.98 
 
 		 550 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.41 
 
 		 548 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.15 
 
 		 545 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.1 
 
 		 548 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.22 
 
 		 548 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  62.45 
 
 		 546 aa  676    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 545 aa  1125    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  57.06 
 
 		 546 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.06 
 
 		 552 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  57.17 
 
 		 547 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.84 
 
 		 546 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.46 
 
 		 546 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.63 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.44 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.97 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.44 
 
 		 560 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.44 
 
 		 560 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.18 
 
 		 560 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  52.26 
 
 		 548 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.94 
 
 		 560 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.13 
 
 		 560 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  54.87 
 
 		 554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  51.89 
 
 		 548 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.32 
 
 		 560 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  54.1 
 
 		 559 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  54.29 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  53.92 
 
 		 559 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.23 
 
 		 560 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  52.26 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.8 
 
 		 560 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  50.56 
 
 		 563 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  48.4 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  47.59 
 
 		 564 aa  504  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  46.69 
 
 		 564 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  48.89 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  48.52 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  47.18 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 601 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.49 
 
 		 601 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.49 
 
 		 601 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.49 
 
 		 601 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.49 
 
 		 601 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.31 
 
 		 601 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  44.08 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 548 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 		 537 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  41.94 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.5 
 
 		 537 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.32 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.89 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.89 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.89 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.89 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.89 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  41.27 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.71 
 
 		 537 aa  389  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.33 
 
 		 537 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  41.17 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 539 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  39.07 
 
 		 534 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  41.23 
 
 		 538 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  38.07 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 543 aa  356  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.66 
 
 		 545 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 		 553 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  38.5 
 
 		 542 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  38.05 
 
 		 542 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 		 542 aa  350  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 550 aa  349  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 		 542 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  37.45 
 
 		 542 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 		 544 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.55 
 
 		 545 aa  347  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  38.18 
 
 		 542 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 545 aa  345  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 		 536 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 		 551 aa  342  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 558 aa  342  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 547 aa  342  8e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 552 aa  341  2e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.83 
 
 		 541 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.31 
 
 		 547 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 		 552 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 		 547 aa  340  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 549 aa  340  5e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.67 
 
 		 545 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 527 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 		 542 aa  339  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 549 aa  339  8e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  37.13 
 
 		 542 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>