More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2146 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2037  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.93 
 
 		 601 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 548 aa  1134    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1435  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.76 
 
 		 601 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1347  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.93 
 
 		 601 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564227  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  64.64 
 
 		 553 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2328  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.93 
 
 		 601 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  79.85 
 
 		 548 aa  941    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3096  AMP-binding domain-containing protein  56.27 
 
 		 601 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1061  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.93 
 
 		 601 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  59.2 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.49 
 
 		 545 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  53.43 
 
 		 546 aa  579  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.83 
 
 		 550 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.01 
 
 		 552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  54.29 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.9 
 
 		 548 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  55.08 
 
 		 554 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.39 
 
 		 560 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.39 
 
 		 560 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.64 
 
 		 560 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.37 
 
 		 560 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  54.58 
 
 		 559 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.64 
 
 		 560 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.39 
 
 		 560 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  54.58 
 
 		 559 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.21 
 
 		 560 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.37 
 
 		 548 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  54.58 
 
 		 555 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.19 
 
 		 560 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.19 
 
 		 546 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.82 
 
 		 548 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 546 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.26 
 
 		 545 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 		 556 aa  537  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 		 548 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.74 
 
 		 560 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 560 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  49 
 
 		 556 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  48.35 
 
 		 564 aa  519  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  47.98 
 
 		 564 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  49 
 
 		 556 aa  521  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  50.83 
 
 		 546 aa  515  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  48.38 
 
 		 563 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  41.64 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 548 aa  365  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 547 aa  363  3e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.99 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 		 537 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 537 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 537 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 537 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.43 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 546 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 550 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.64 
 
 		 541 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  37.92 
 
 		 542 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.15 
 
 		 536 aa  354  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.03 
 
 		 558 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.83 
 
 		 545 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 550 aa  353  5e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 543 aa  353  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 		 546 aa  352  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 549 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.1 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 533 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 542 aa  349  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 		 551 aa  349  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 		 552 aa  348  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.27 
 
 		 546 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  38.08 
 
 		 534 aa  347  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  35.99 
 
 		 546 aa  347  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.59 
 
 		 569 aa  346  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 546 aa  346  8e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 546 aa  346  8e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  37.17 
 
 		 542 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  37.15 
 
 		 542 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.4 
 
 		 547 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2557  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 555 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 544 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.4 
 
 		 569 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 539 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  36.8 
 
 		 542 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.71 
 
 		 542 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 		 534 aa  342  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 		 547 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 537 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 		 547 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>